گزارشهای مربوط به حقوق شهروندی مسلمانان در آمریکا، بیانگر حقیقت مهم دیگری است که باید به این مسئله افزود و آن نیز افزایش تبعیض بر ضد حقوق مسلمانان آمریکایی از سوی نهادهای دولتی و قوه مجریه است.